果树学硕士学位授权点
该授权点为园艺学一级学位授权点下设的二级硕士学位授权点。有研究生指导教师5人，其中教授3人，副教授2人，具有博士学位3人；具有校级导师团队——果树种质资源与遗传育种团队，带头人为扈惠灵教授。
果树学硕士学位授权点从2013年开始招生，招生方向为果树种质资源与遗传育种、果树栽培生理、果树生物技术等。
蔬菜学硕士学位授权点
该授权点为园艺学一级学位授权点下设的二级硕士学位授权点。有校内指导教师5人、校外指导教师1人，其中教授4人，副教授2人，具有博士学位者3人；具有3个校级导师团队——蔬菜安全生产技术团队、蔬菜种质资源与育种团队、蔬菜栽培生理与生态团队，带头人为王广印教授、周俊国教授、李新峥教授。
蔬菜学硕士学位授权点从2007年开始招生，招生方向为是蔬菜栽培生理与生态、蔬菜种质资源与育种研究、蔬菜安全生产技术体系等。
观赏园艺学硕士学位授权点
该授权点为园艺学一级学位授权点下设的二级硕士学位授权点。有校内指导教师7人，其中教授4人，副教授3人，具有博士学位者7人；具有1个校级导师团队——观赏植物种质资源与创新利用团队，带头人为刘会超教授。
观赏园艺学硕士学位授权点从2013年开始招生，招生方向为观赏植物栽培生理与生态、观赏植物种质资源与创新、观赏植物生物技术与遗传育种等。
风景园林学硕士学位授权点
该授权点为一级学科硕士学位授权点。有硕士导师17人，其中教授4人，副教授8人，具有博士学位14人；具有校外导师2人，其中教授1人，副研究员1人，具有博士学位1人。
风景园林学院硕士授权从2018年开始招生，招生方向为风景园林规划与设计、园林植物种质资源创新与应用等。
农艺与种业领域专业硕士学位授权点
该硕士授权点为二类专业硕士授权点。有校内指导教师17人，其中教授7人，副教授6人，具有博士学位者13人；校外导师5人，教授级高级工程师1人，高级工程师2人，副研究员1人，具有博士学位者1人。
该硕士授权点从2015年开始招生，招生方向为园艺植物生物技术遗传与育种、园艺植物栽培与生理生态、园艺植物种质资源创新与利用、果蔬品质与营养生理等。
风景园林硕士学位授权点
该硕士授权为一类专业硕士学位授权点。有硕士导师18人，其中教授4人，副教授9人，具有博士学位14人；具有校外导师4人，其中教授1人，副教授1人，高级工程师2人。
风景园林硕士从2018年开始招生，招生方向为风景园林规划与设计、园林植物应用等。
